Par sa géographie de hautes montagnes et de plaines, le Népal dispose d’une grande diversité climatique. On y trouve différentes sortes d'espèces animales et végétales. Les écosystèmes sont aussi divers que les climats. La faune et la flore du Népal sont typiques du continent européen et de la partie nord et sud de l'Asie. On les retrouve aussi en Inde. À ce jour, on recense plus de 6500 espèces végétales au Népal. La faune est aussi variée que la flore, mais les espèces animales de ce pays de l'Himalaya sont menacées de disparition. Le gouvernement népalais mène une lutte acharnée pour la protection de l'environnement et la conservation de cet écosystème qui attire de nombreux touristes chaque année. Les mesures prises semblent suffisantes pour éloigner les braconniers qui chassaient les tigres et les rhinocéros il n'y a pas si longtemps. On recense de nombreuses espèces animales, dont plus de 850 espèces d'oiseaux, des reptiles, des amphibiens ainsi que de mammifères. 3 % des espèces animales qu'on retrouve au Népal sont des espèces endémiques (qu'on ne trouve nulle part ailleurs). Les variétés de papillons et les plantes indigènes comme les orchidées exotiques ajoutent couleurs et gaieté aux paysages népalais.
Parmi les espèces animales du Népal: les crocodiles des marais, les rhinocéros à une seule corne (Rhinoceros unicornis), les éléphants d'Asie (Elephas maximus), les macaques, les tigres royaux du Bengale, les ours (Sloth bear). On peut généralement trouver ces animaux dans la région du Teraï. Au fur et à mesure qu'on monte en altitude, on peut trouver les antilopes, les ours noirs d'Asie, les pandas rouges (Ailurus Fulgens), les renards du Tibet (Vulpes ferrilata), les loups himalayens (Canis himalayensis) ainsi que les chèvres himalayennes (aussi appelées Thar). Les régions montagneuses du Népal abritent également des cerfs et des sangliers. Il est également possible de rencontrer le léopard des neiges.
On trouve au Népal bon nombre d'espèces de mammifères, équivalent à 4% de toutes celles que l'on retrouve sur l'ensemble de la planète. En plus des animaux nommés précédemment, on trouve également le dauphin du Gange.
Les derniers recensements ont permis de découvrir plus de 850 espèces d'oiseaux parmi lesquels figurent les hérons, les vautours, les aigles, les canards sauvages, les aigrettes, les cigognes, les coucous ainsi que les paons. Le lophophore ou danphé, un oiseau appartenant à la famille des faisans est d'ailleurs l'oiseau national du Népal. Le nid de cet oiseau (aussi appelé Himalayan Monal) se trouve généralement à une altitude de 4000 m.
Certains animaux sont en voie d'extinction, que ce soient des espèces que l'on retrouve en montagne ou des espèces que l'on trouve dans les différentes plaines du Népal. Tristement, on rencontre de moins en moins de cerfs musqués et de moutons tibétains en région alpine et en région subalpine. Les léopards et les tigres font l'objet de chasse parce que leurs peaux se vendent très cher. Les rhinocéros quant à eux sont chassés pour leurs cornes, à partir desquelles on fabrique une poudre utilisée en médecine traditionnelle, notamment en Chine et au Vietnam. Par le passé, des gardes chargés de veiller sur les parcs nationaux ont été accusés de complicité avec les braconniers. Heureusement, les choses ont changé : le Népal a connu plusieurs années sans aucun rhinocéros braconné depuis 2011, et le recensement de 2021 comptait 752 rhinocéros, tandis que celui publié le 29 juillet 2026 dénombre 429 tigres, près de quatre fois plus qu'en 2010.
Le Népal comprend aujourd'hui douze parcs nationaux, une réserve de faune, une réserve de chasse, six aires de conservation et leurs zones tampons. Ces espaces protégés représentent environ 23 % de la surface totale du Népal. Ces aires protégées ont été mises en place dans le but de protéger les différentes espèces animales en voie de disparition.